需要質(zhì)譜分析的工作流程：

• 蛋白質(zhì)鑒定和表征：確定蛋白質(zhì)的一級結(jié)構(gòu)和翻譯后修飾。
• 定量蛋白質(zhì)組學：測量不同樣本之間蛋白質(zhì)表達水平的變化。
• 小分子分析：包括藥物代謝研究、殘留分析、環(huán)境污染物檢測。

進行質(zhì)譜分析的方法：

MALDI-TOF（基質(zhì)輔助激光解吸/電離--飛行時間質(zhì)譜，Matrix-Assisted Laser Desorption/Ionization – Time of Flight）

MALDI-TOF 是一種 “軟電離 ”技術(shù)，非常適合分析蛋白質(zhì)和肽等大型生物分子，而不會造成碎裂。通過將樣品與基質(zhì)混合并使用激光脈沖，它可以使樣品離子化。它的主要優(yōu)勢在于能夠快速分析大分子，因此在蛋白質(zhì)組學和微生物鑒定方面特別有用。

電噴霧電離(Electrospray Ionization, ESI)

ESI 的工作原理是將樣品溶液通過高壓針，產(chǎn)生帶電液滴，從而產(chǎn)生離子。它的多功能性非常突出，可以電離從小分子到大蛋白質(zhì)的各種化合物。ESI 與液相色譜法（LC）兼容，可實現(xiàn)無縫分離和后續(xù) MS 分析，是代謝組學和脂質(zhì)組學的首選。

串聯(lián)質(zhì)譜法（Tandem Mass Spectrometry, MS/MS）

MS/MS 分為兩個階段，首先分離離子，然后對選定的離子進行碎片化，最后對碎片進行分析。其優(yōu)勢在于提供詳細的結(jié)構(gòu)信息，尤其是肽的結(jié)構(gòu)信息。通過瞄準特定離子并監(jiān)測其碎片，MS/MS 提供了無與倫比的特異性和精確性，使其在蛋白質(zhì)組學和精確定量分析方面具有無可估量的價值。

質(zhì)譜樣品制備

為質(zhì)譜分析準備生物樣本的過程。這包括從復雜混合物中提取、純化和濃縮相關(guān)分子。其主要目的是確保樣品的形態(tài)適合質(zhì)譜分析，不含可能干擾質(zhì)譜讀數(shù)的污染物，并且濃度足以被檢測到。

如何實現(xiàn)質(zhì)譜樣品制備過程的自動化：

• 移液工作站：這些工作站可以自動進行移液，減少人為錯誤并提高通量。
• 自動化SPE系統(tǒng): 無需人工干預即可處理提取和凈化步驟。
• 整合系統(tǒng): 一些系統(tǒng)可以集成樣品制備過程中從提取到凈化到濃縮的多個步驟。