Fidabio 使用 OT-2 和 Opentrons Python Protocol API 創(chuàng)建了分析蛋白質(zhì)相互作用的設(shè)備，用于生物藥物開發(fā)。

Fidabio是一家由哥本哈根大學(xué)的研究人員創(chuàng)立的生物技術(shù)公司，坐落于丹麥，核心業(yè)務(wù)是幫助科研工作者推進(jìn)復(fù)雜的生物學(xué)項(xiàng)目，例如多重結(jié)合蛋白、脂質(zhì)體、外泌體和雙特異性研究項(xiàng)目。Fidabio發(fā)明的FIDA技術(shù)可在天然條件下對蛋白質(zhì)和納米顆粒進(jìn)行簡單、準(zhǔn)確和快速的檢測和表征。

今天我們采訪的是 Fidabio 的 CEO Brian S?rensen 和 CSO Henrik Jensen。為了創(chuàng)建一臺用于分析生物藥物開發(fā)過程中的蛋白質(zhì)間相互作用的設(shè)備。他們使用了 Opentrons OT-2 自動化移液機(jī)器人和 Opentrons Python API 以及他們自己的軟件集成創(chuàng)建了用于樣品制備的復(fù)雜稀釋工作流程。Brian S?rensen 和 Henrik Jensen 會給大家分享他們的 OT-2 的使用體驗(yàn)。

Opentrons: 請您介紹一下您的研究背景。

Brian S?rensen:?我們一直在哥本哈根大學(xué)工作，直到去年年底。

Henrik Jensen:?在大學(xué)里，我們使用OT-2自動化移液平臺進(jìn)行樣品制備工作流程中的梯度稀釋工作。我認(rèn)為 OT-2 自動化帶來的便利性能夠有助于在實(shí)驗(yàn)室內(nèi)進(jìn)行整體集成。

Opentrons: 您的研究項(xiàng)目是什么樣的？

Brian S?rensen:?我們的內(nèi)部試點(diǎn)通常是小型實(shí)驗(yàn)，手動移液也是可以滿足的。但是，當(dāng)我們的客戶需要進(jìn)行大型實(shí)驗(yàn)時(shí)，讓技術(shù)人員僅靠提升手動移液速度來實(shí)現(xiàn)是不可行的。機(jī)器人可以代替人工移液，科研人員可以把這些時(shí)間節(jié)省下來用來做實(shí)驗(yàn)分析。一旦實(shí)驗(yàn)涉及更大的稀釋系列，或需要分裝更多樣品時(shí)，就需要用到自動化。我舉一個例子，我有一個客戶分析了附近醫(yī)院的數(shù)千個患者樣本，這么大批量的操作是需要通過自動化來實(shí)現(xiàn)的。

Opentrons: 您為什么選擇 OT-2？

Brian S?rensen:?我們購買了獨(dú)立的液體處理機(jī)器人，但很快就發(fā)現(xiàn)我們可以將其與我們自己的軟件集成。

Henrik Jensen:?自動化的優(yōu)勢我認(rèn)為有以下幾點(diǎn)：第一，可以幫助我們處理大量的樣本。第二，在實(shí)驗(yàn)室工作中，準(zhǔn)確性也很重要。如果您能以標(biāo)準(zhǔn)化的方式進(jìn)行工作，則自動化有利于改善結(jié)果。

Brian S?rensen:?可重復(fù)性是關(guān)鍵，您在實(shí)驗(yàn)室中人為因素越高，則可重復(fù)性就越低。

Henrik Jensen:?第三，如果您可以使用機(jī)器人，在整個工作流程中我們對操作員在知識和技能層面的要求將變得更小。

Brian S?rensen:?如果您只是做一些常規(guī)分析，那么您可以手動完成所有工作。但這可能不是進(jìn)行整個檢測的最佳方式，且不能更好地發(fā)揮技術(shù)人員的最大價(jià)值。

Henrik Jensen:?使用自動化移液平臺，您可以更輕松地記錄您的研究，因?yàn)槟梢怨蚕硪埔耗_本，研究人員可以重現(xiàn)數(shù)據(jù)。自動化能夠詳細(xì)呈現(xiàn)您的下一步操作以及歷史操作。

Brian S?rensen:?如果您想將您的實(shí)驗(yàn)從實(shí)驗(yàn)室轉(zhuǎn)移到另一個實(shí)驗(yàn)室，并且實(shí)驗(yàn)中有手動步驟?—

Henrik Jensen:?—自動化要容易得多。這一因素也是我們將制備環(huán)節(jié)甚至整個工作流程都變成自動化的根本原因之一。

Brian S?rensen:?最初集成OT-2時(shí)，我們認(rèn)為它是一個不錯的小眾應(yīng)用。但是，當(dāng)我們看到更多客戶也有興趣將 OT-2 作為其 Fidabio 工作流程的一部分。我們可以在軟件中看到無縫集成更多實(shí)驗(yàn)室的可能性。于是我們就把Fidabio的軟件和Opentrons連接在一起。

Opentrons: 您的OT-2的實(shí)際使用體驗(yàn)怎么樣？

Henrik Jensen:?從硬件的角度來看，它即插即用，非常方便。不過在協(xié)議方面仍然有一些需要我們學(xué)習(xí)的地方，但其實(shí)這也不難。我們的軟件工程師 Morten 自己編寫了腳本。腳本的創(chuàng)建實(shí)際上非常簡單。

Brian S?rensen:?OT-2 可以無縫融入我們的工作流程。它簡化了生成結(jié)合曲線的工作。我們把大量重復(fù)移液的工作交給機(jī)器人完成而不是占用技術(shù)人員的時(shí)間，節(jié)省了人力成本和時(shí)間成本。同時(shí) OT-2 這非常適合我們的系統(tǒng)以及其他自動化實(shí)驗(yàn)室系統(tǒng)。它是一個端到端的自動化工作流程。

Henrik Jensen:?我們之前沒有這方面的經(jīng)驗(yàn)。但是，由于我們自己也是儀器開發(fā)人員，我們已經(jīng)對這個過程已經(jīng)有了很好的理解。

Opentrons: 在購買OT-2之前，您使用過其他實(shí)驗(yàn)室自動化設(shè)備嗎？您對實(shí)驗(yàn)室自動化的過程有什么期望？

Brian S?rensen:?當(dāng)我們開發(fā)自己的平臺時(shí)，高度自動化對我們來說很重要。從這個意義上說，OT-2 很好地增強(qiáng)了我們自己的一個關(guān)鍵賣點(diǎn)。它與我們自己平臺中的關(guān)鍵元素之一非常吻合。

Opentrons: 您使用 OT-2 的具體用途是什么，它如何融入您的工作流程？

Brian S?rensen:?對我們來說，我們銷售的儀器必須非常精確。我們知道我們的技術(shù)有能力提供非常準(zhǔn)確的數(shù)據(jù)，但在生物學(xué)界，即使是很小的變化也會影響結(jié)果。尤其是我們使用的應(yīng)用程序（例如藥物研發(fā)），我們必須確保我們盡可能多地控制實(shí)驗(yàn)。為保障更好的實(shí)驗(yàn)產(chǎn)出嚴(yán)格控制準(zhǔn)備過程。

Henrik Jensen:?在我們整合之前，我們有一個分析開發(fā)合作伙伴，它允許我們將信息輸入系統(tǒng)，系統(tǒng)會計(jì)算出您需要什么來制作解決方案。以前我們是手動進(jìn)行的。但接下來我們會用OT-2制作腳本，而不是手動進(jìn)行。

Opentrons: 您是否有其他自動化項(xiàng)目的計(jì)劃？

Brian S?rensen:?我們一直在尋找進(jìn)一步的發(fā)展。雖然我們公司還年輕，但我們正在快速發(fā)展期，未來可能會嘗試更多的整合和開發(fā)項(xiàng)目。

Opentrons: 關(guān)于使用 OT-2，您還有其他想要分享的嗎？

Henrik Jensen:?開放性以及與多個平臺集成的能力是 Opentrons 產(chǎn)品的一個非常重要的優(yōu)勢。

Brian S?rensen:?我們已經(jīng)與 Opentrons 的產(chǎn)品開發(fā)團(tuán)隊(duì)討論了我們產(chǎn)品之間進(jìn)一步集成的方式，以便為我們的客戶提供無縫銜接的工作流程并提高用戶效率。這個需求目前在市場上需求量很大。我們在客戶中看到的趨勢是：他們對量化和準(zhǔn)確性的需求與日俱增；且越復(fù)雜的實(shí)驗(yàn)室工作流程，要求就越多……而且消除錯誤源的需求也越大。實(shí)驗(yàn)室自動化的驅(qū)動力不是自動化本身，而是它可以提供最高質(zhì)量的實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)。

Henrik Jensen:?自動化不僅僅是為了給實(shí)驗(yàn)室創(chuàng)造更便宜、更易于使用的產(chǎn)品。我們必須考慮如何實(shí)現(xiàn)自動化的方法，必須考慮整個實(shí)驗(yàn)過程。

Brian S?rensen: 生物技術(shù)公司長期以來一直在努力解決這個問題?？蛻粽趯ふ铱梢詭椭麄冏龀鰶Q定的東西。他們能盡快找到解決方案，他們的開發(fā)過程就越高效。這是該過程中的一個重要突破。

點(diǎn)擊這里下載 Fidabio 的軟件說明和 Opentrons 集成信息。