一個強大的生物工廠不需要數百萬美元的投資——經濟實惠的開源工具讓每個實驗室都有可能實現這些功能。

DAMP 實驗室是波士頓大學生物設計中心內一個初創(chuàng)的生物工廠。該實驗室僅使用不到 10,000 美元的開源軟件和硬件，就為科學界提供了 30 種合成生物學方案（如DNA組裝、轉化、測序和質粒純化等），并以此收取服務費。任何科學家都可以通過訪問 DAMP 實驗室的網頁界面遠程指定實驗計劃，其自動化系統(tǒng)能夠設計、構建和測試該計劃。

他們是如何做到的呢？

通過整合一系列開源工具，DAMP實驗室能夠快速開發(fā)一個復雜的系統(tǒng)，該系統(tǒng)能夠高效且優(yōu)雅地自動化執(zhí)行生物回路測試。其中一些關鍵的開源工具包括：

• Cello 使用Verilog編程語言實現生物回路的自動化設計。
• Aquarium 用于實驗室信息管理系統(tǒng)（LIMS），實現作業(yè)排隊和庫存管理。
• Opentrons 的OT-2移液機器人：用于自動化DNA組裝、轉化和其他許多方案。

您可以在 Synbiobeta 博客上了解更多關于 DAMP 實驗室技術堆棧的信息。

為什么DAMP實驗室的生物工廠和開源技術如此重要？

DAMP實驗室在視頻中談到了開源技術和它賦予的能力。

該項目展示了開源軟件和硬件在實驗室中的力量。如果手動執(zhí)行所有這些過程，DAMP實驗室需要一周時間來設計、構建和測試10個基因回路。通過在開源技術上投入相對較少的資金，DAMP實驗室的吞吐量提高了10倍。

結果就是，DAMP實驗室能夠用相同的設施和團隊執(zhí)行10倍的實驗。開源工具提高了生產效率，大大降低了執(zhí)行復雜實驗的成本。

一個強大的生物工廠不需要數百萬美元的投資——經濟實惠的開源工具讓每個實驗室都有可能實現這些功能。