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分析樣本制備

這是一個(gè)關(guān)鍵過(guò)程,將樣本轉(zhuǎn)化為適合分析程序(如PCR、NGS和細(xì)胞實(shí)驗(yàn))的格式。

分析樣本準(zhǔn)備可能包括提取/純化、濃縮/稀釋或修改,這取決于分析的要求。盡管其重要性不言而喻,但它帶來(lái)了諸多挑戰(zhàn),如保持重復(fù)性、避免污染以及管理勞動(dòng)密集型工作流程——尤其是手動(dòng)操作時(shí)。自動(dòng)化系統(tǒng)可以解決這些問(wèn)題,提供更高的準(zhǔn)確性、增強(qiáng)的重復(fù)性、節(jié)省時(shí)間和勞動(dòng),并降低污染風(fēng)險(xiǎn)。

手動(dòng)標(biāo)準(zhǔn)化、使用液體處理系統(tǒng)的標(biāo)準(zhǔn)化和使用微孔板讀數(shù)器的標(biāo)準(zhǔn)化是執(zhí)行這一過(guò)程的一些方法。然而,自動(dòng)化系統(tǒng)因其更高的準(zhǔn)確性、重復(fù)性和效率以及降低的污染風(fēng)險(xiǎn)而越來(lái)越受到青睞。



分析樣本制備的工作流程

分析樣本制備是分子生物學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)等許多工作流程的基礎(chǔ):

  1. PCR和qPCR:在這些過(guò)程中,樣本準(zhǔn)備包括DNA或RNA的提取和純化。
  2. 下一代測(cè)序(NGS):在NGS工作流程中,樣本準(zhǔn)備涉及步驟如DNA片段化、接頭連接和擴(kuò)增。
  3. 蛋白質(zhì)分析:對(duì)于像ELISA或Western blot這樣的蛋白質(zhì)分析,樣本準(zhǔn)備可能包括蛋白質(zhì)提取、定量和可能的變性處理。
  4. 細(xì)胞實(shí)驗(yàn):在這些實(shí)驗(yàn)中,樣本準(zhǔn)備可能包括培養(yǎng)細(xì)胞、用特定化合物處理細(xì)胞,然后可能需要裂解細(xì)胞以釋放其內(nèi)容物。

分析樣本制備從未如此簡(jiǎn)單

OT-2 是一款臺(tái)面式液體工作站,設(shè)計(jì)方便靈活,可自動(dòng)處理許多常見(jiàn)應(yīng)用。

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分析樣本制備的最佳方法

  1. 提取/純化:這可能涉及像苯酚-氯仿提取這樣的DNA或RNA提取過(guò)程,或用于蛋白質(zhì)純化的各種色譜技術(shù)。
  2. 濃縮/稀釋?zhuān)簶颖究赡苄枰褂秒x心過(guò)濾器等方法進(jìn)行濃縮,或稀釋至適合分析的濃度。
  3. 修改:一些分析需要在分析前對(duì)樣本進(jìn)行化學(xué)或酶學(xué)修改。例如,蛋白質(zhì)可能需要在運(yùn)行SDS-PAGE之前進(jìn)行變性和還原。

協(xié)議亮點(diǎn)

Opentrons 可幫助您使用 OT-2和 Opentrons Flex 的開(kāi)源協(xié)議自動(dòng)進(jìn)行分析樣本制備

為什么分析樣本制備如此閑難?

分析樣本制備通常被認(rèn)為是實(shí)驗(yàn)過(guò)程最具挑戰(zhàn)性的部分。它需要高度的精確性和準(zhǔn)確性,以確保結(jié)果的重復(fù)性。在這個(gè)階段,樣本最容易受到污染或降解,這可能導(dǎo)致結(jié)果不準(zhǔn)確。此外,最佳的樣本準(zhǔn)備協(xié)議可能會(huì)因樣本類(lèi)型和特定分析的不同而有很大差異。

使用手動(dòng)移液進(jìn)行分析樣本制備的關(guān)鍵挑戰(zhàn)

  1. 重復(fù)性:即使是移液技術(shù)中的微小變化也可能導(dǎo)致結(jié)果的顯著差異。
  2. 污染:在準(zhǔn)備過(guò)程中,樣本容易受到污染,特別是在手動(dòng)移液時(shí)。
  3. 時(shí)間和勞動(dòng)密集型:手動(dòng)準(zhǔn)備樣本進(jìn)行分析可能非常耗時(shí)且勞動(dòng)密集,尤其是當(dāng)處理大量樣本時(shí)。

分析樣本的自動(dòng)化制備

分析樣本制備的自動(dòng)化可以通過(guò)機(jī)器人液體處理系統(tǒng)實(shí)現(xiàn)。這些系統(tǒng)可以準(zhǔn)確地分配精確體積,混合試劑,甚至執(zhí)行加熱或冷卻等操作。使用這些系統(tǒng)可以減少人為錯(cuò)誤,提高重復(fù)性,并顯著加快樣本準(zhǔn)備過(guò)程。

與手動(dòng)相比,自動(dòng)化制備分析樣本的優(yōu)勢(shì)

  1. 提高重復(fù)性:自動(dòng)化系統(tǒng)確保樣本處理?xiàng)l件的一致性,從而提高實(shí)驗(yàn)之間的重復(fù)性。
  2. 節(jié)省時(shí)間和勞動(dòng):自動(dòng)化系統(tǒng)能夠同時(shí)處理多個(gè)樣本,顯著減少所需的時(shí)間和勞動(dòng)。
  3. 降低污染風(fēng)險(xiǎn):自動(dòng)化系統(tǒng)減少了人工處理的數(shù)量,從而降低了污染的風(fēng)險(xiǎn)。

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