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HIT挑選 [櫻桃挑選]

HIT挑選,通常稱為櫻桃挑選,是從大量樣本中精確選擇顯示出所需特征的特定樣本或‘HIT’的過(guò)程。這在藥物發(fā)現(xiàn)、高通量篩選、基因組研究和蛋白質(zhì)組學(xué)等工作流程中至關(guān)重要。

HIT挑選和櫻桃挑選本質(zhì)上指的是相同的過(guò)程。兩個(gè)術(shù)語(yǔ)都描述了基于所需特征從較大樣本集中選擇和分離特定樣本或‘HIT’的過(guò)程。這一過(guò)程在藥物發(fā)現(xiàn)、基因組研究和蛋白質(zhì)組學(xué)等高通量工作流程中至關(guān)重要。

HIT挑選的規(guī)模帶來(lái)了挑戰(zhàn),特別是在手動(dòng)操作時(shí),可能會(huì)出現(xiàn)人為錯(cuò)誤、體力疲勞和處理速度慢的問(wèn)題。為了減輕這些問(wèn)題,建議自動(dòng)化HIT挑選。自動(dòng)化系統(tǒng)結(jié)合了機(jī)器人技術(shù)和液體處理設(shè)備,可以快速而準(zhǔn)確地選擇‘HIT’,通常還包括條形碼識(shí)別、溫控和數(shù)據(jù)管理軟件等功能。

HIT 挑選 Vs. 櫻桃挑選

術(shù)語(yǔ)‘HIT挑選’起源于從大規(guī)模篩選過(guò)程中選擇‘HIT’或陽(yáng)性結(jié)果的實(shí)踐,通常是在識(shí)別潛在藥物候選者的背景下使用。‘HIT’這個(gè)術(shù)語(yǔ)具有隱喻意義,用以表示一個(gè)積極的結(jié)果,就像在靶向游戲中命中目標(biāo)一樣。

另一方面,‘櫻桃挑選’這個(gè)術(shù)語(yǔ)從最初的背景(從樹(shù)上挑選最成熟或最理想的櫻桃)遷移過(guò)來(lái)。在科學(xué)研究中,櫻桃挑選指的是從較大的樣本集中仔細(xì)選擇最有前景或最合適的樣本進(jìn)行進(jìn)一步分析的實(shí)踐。

需要 HIT 挑選的工作流程HIT 挑選在以下工作流程中尤為重要:1.  藥物發(fā)現(xiàn):在高通量篩選過(guò)程中用于識(shí)別顯示出對(duì)感興趣靶標(biāo)具有活性的有前景的化合物。2.  基因組研究:特別是在克隆文庫(kù)構(gòu)建和篩選中,需要分離顯示出期望表型或基因型的特定克隆。3.  蛋白質(zhì)組學(xué):用于識(shí)別與目標(biāo)分子相互作用或展示期望功能的‘HIT’蛋白質(zhì)。

Cherrypicking從未如此簡(jiǎn)單

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HIT挑選的最佳方法1.  手動(dòng)移液:這種方法涉及使用移液器手動(dòng)處理每個(gè)樣本。盡管這種方法精度高,但勞動(dòng)強(qiáng)度大且耗時(shí)。2.  機(jī)器臂系統(tǒng):這些系統(tǒng)可以自動(dòng)化移液過(guò)程,提高通量并減少人為錯(cuò)誤。3.  聲學(xué)分配:這是一種非接觸的方法,通過(guò)聲波轉(zhuǎn)移少量液體。它具有高度的精確性,并能處理大規(guī)模樣本庫(kù)。

協(xié)議亮點(diǎn)

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為何 HIT 挑選如此困難?

櫻桃挑選因任務(wù)規(guī)模龐大而具有挑戰(zhàn)性。在高通量工作流程中,可能需要篩選成千上萬(wàn)甚至數(shù)百萬(wàn)個(gè)樣本。手動(dòng)選擇和處理‘HIT’可能非常繁瑣、耗時(shí),并且容易出錯(cuò)。

手動(dòng)移液的HIT挑選主要面臨以下挑戰(zhàn):

  1. 通量:手動(dòng)移液無(wú)法匹配自動(dòng)化系統(tǒng)的速度,因而不適合大規(guī)模項(xiàng)目。
  2. 錯(cuò)誤:手動(dòng)移液容易出現(xiàn)人為錯(cuò)誤,如移液不準(zhǔn)確、交叉污染或樣本識(shí)別錯(cuò)誤。
  3. 疲勞:重復(fù)的移液操作可能導(dǎo)致身體疲勞,從而進(jìn)一步增加錯(cuò)誤的風(fēng)險(xiǎn)。

如何實(shí)現(xiàn) HIT 挑選流程的自動(dòng)化

HIT挑選(櫻桃挑選)的自動(dòng)化通常涉及將機(jī)器人系統(tǒng)與液體處理設(shè)備集成。這些系統(tǒng)可以根據(jù)預(yù)設(shè)標(biāo)準(zhǔn)快速且準(zhǔn)確地挑選‘HIT’。它們通常包括樣本追蹤的條形碼功能、用于樣本穩(wěn)定性的溫控功能,以及用于數(shù)據(jù)管理和分析的軟件。

與手動(dòng)相比,自動(dòng)化處理HIT挑選的優(yōu)勢(shì)

  1. 提高通量:自動(dòng)化系統(tǒng)可以在顯著更短的時(shí)間內(nèi)處理更大的樣本量。
  2. 減少錯(cuò)誤:自動(dòng)化最小化了人為錯(cuò)誤,確保結(jié)果更加準(zhǔn)確和可靠。
  3. 重復(fù)性:自動(dòng)化系統(tǒng)提供一致的操作性能,確保不同運(yùn)行和操作人員之間的結(jié)果更具可重復(fù)性。
  4. 成本效益:盡管初期投資可能較高,但自動(dòng)化系統(tǒng)通過(guò)降低勞動(dòng)成本和提高效率,從長(zhǎng)遠(yuǎn)來(lái)看可以更具成本效益。

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