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使用 Opentrons Flex? 核酸提取工作站純化從細胞或組織樣本提取基因組 DNA

應(yīng)用優(yōu)勢

使用 Opentrons Flex? 搭配NucleoMag? Tissue 試劑盒,進行純化核酸的優(yōu)勢:

1.方法經(jīng)過驗證,確保全自動提取純化過程準(zhǔn)確性。
2.產(chǎn)量和純度重復(fù)性好,穩(wěn)定回收基因組 DNA。
3.處理能力強,可最多同時處理 96個樣品。
4.可訪問 Opentrons 協(xié)議庫或通過MACHEREY NAGEL 的自動化技術(shù)支持automation-bio@mn-net.com獲取更多詳細信息。

導(dǎo)言

提取基因組 DNA 是生命科學(xué)和應(yīng)用測試實驗室中常見的實驗流程,尤其在基因分型測試、測序和臨床研究等下游應(yīng)用中,對 DNA 的質(zhì)量和純凈度要求嚴(yán)格。
MACHEREY NAGEL 的 NucleoMag? Tissue 試劑盒提供了基于磁珠的快速基因組 DNA 純化解決方案。該試劑盒設(shè)計精簡,適用于 96 孔板模式,可為 PCR、NGS 或其他酶反應(yīng)提供高質(zhì)量、高純凈度的 DNA 模板。
結(jié)合 Opentrons Flex? 核酸提取工作站,可高效純化 HeLa 細胞基因組DNA。該工作站配備Opentrons Flex? 環(huán)形磁力架、加熱振蕩模塊,以及5-1000 μL 單通道和 8 通道移液器,還可選擇 96 通道移液器,適用于各種樣本類型提取 DNA,包括其他真核細胞或組織。
Opentrons Protocol Library 中提供了結(jié)合 Opentrons Flex? 核酸提取工作站與 NucleoMag? Tissue 試劑盒使用的協(xié)議,可直接下載使用。

應(yīng)用說明 NucleoMag? 組織與 Opentrons Flex?

NucleoMag? Tissue 試劑盒的原理是基于核酸在特定結(jié)合條件下可逆吸附到 NucleoMag?B-beads 上。在處理高達 20 mg 的組織樣本或 1×10^6 個 細胞時,首先加入蛋白酶 K 和裂解緩沖液T1,然后通過加入緩沖液 MB2 促進核酸與磁珠的可逆結(jié)合。隨后,在磁珠吸附后,使用洗滌緩沖液 MB3 和 MB4 進行洗滌,以去除鹽和其他雜質(zhì)。接著進行干燥步驟或進行 MB5 洗滌,最后使用洗脫緩沖液 MB6 將 DNA 洗脫下來。所有的移液和磁珠純化步驟都由 Opentrons Flex? 完成。

應(yīng)用數(shù)據(jù)

應(yīng)用數(shù)據(jù)

從HeLa細胞中提取DNA

利用 Opentrons Flex? 工作站搭配 NucleoMag? Tissue 試劑盒,成功從2.4×10^5 個 HeLa 細胞中提取了高純度 DNA。通過使 TapeStation 對純化后的 DNA 進行評估,包括評估 DNA 完整性(DIN)和片段大小分布(虛擬凝膠成像),結(jié)果顯示 DNA 的平均 DIN 值為9.0±0.09。這表明 Opentrons Flex? 工作站與 NucleoMag? Tissue試劑盒結(jié)合使用,能夠穩(wěn)定地從 HeLa 細胞中提取高質(zhì)量的 DNA 。

值得信賴的 qPCR 檢測結(jié)果

通過進行 qPCR 分析(用藍色條表示),使用 PowerTrackTM SYBR GreenMaster Mix 作為試劑,引物經(jīng) IDT 設(shè)計,靶向基因組中 β-2- 微球蛋白的一個 190 bp 區(qū)域。qPCR 結(jié)果顯示,在所有測試樣本中都能穩(wěn)定檢測到擴增片段,表明這個自動化核酸純化流程適用于各種常見的基于酶的下游應(yīng)用。這些結(jié)果證明了 Opentrons Flex? 工作站搭配 NucleoMag? Tissue 試劑盒提取的 DNA 在 qPCR 檢測中表現(xiàn)出可靠性。

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