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Flex高通量NGS平臺(tái)適合中小實(shí)驗(yàn)室嗎?
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如何使用Flex平臺(tái)完成NGS文庫(kù)建庫(kù)全過(guò)程?
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NGS(Next Generation Sequencing,下一代測(cè)序)實(shí)驗(yàn)室工作站是專(zhuān)為高通量測(cè)序技術(shù)設(shè)計(jì)的自動(dòng)化工作平臺(tái),它集成了多種功能模塊,包括樣本前處理、文庫(kù)構(gòu)建、PCR擴(kuò)增、測(cè)序前準(zhǔn)備以及(在某些情況下)數(shù)據(jù)分析等步驟,旨在提高實(shí)驗(yàn)效率、減少人為誤差,并確保實(shí)驗(yàn)結(jié)果的準(zhǔn)確性和可重復(fù)性。
一、NGS實(shí)驗(yàn)室工作站主要特點(diǎn)
1、高度自動(dòng)化:
1>自動(dòng)化處理樣本:從樣本的分裝、核酸提取、文庫(kù)構(gòu)建到測(cè)序前準(zhǔn)備,均可實(shí)現(xiàn)無(wú)人值守或極少人工干預(yù)的自動(dòng)化操作。
2>自動(dòng)化數(shù)據(jù)分析:部分工作站還集成了數(shù)據(jù)分析軟件,能夠自動(dòng)處理測(cè)序數(shù)據(jù),提高分析效率和準(zhǔn)確性。
2、高精度和一致性:
1>通過(guò)精密的儀器和優(yōu)化的實(shí)驗(yàn)流程,確保每次實(shí)驗(yàn)結(jié)果的穩(wěn)定性和一致性。
2>減少人為操作帶來(lái)的誤差和污染風(fēng)險(xiǎn)。
3、高效性:
1>大幅提高實(shí)驗(yàn)通量,支持同時(shí)處理多個(gè)樣本。
2>縮短實(shí)驗(yàn)周期,提高實(shí)驗(yàn)室整體工作效率。
4、靈活性:
1>工作站通常支持多種NGS試劑和方案,滿(mǎn)足不同實(shí)驗(yàn)需求。
2>可根據(jù)實(shí)驗(yàn)室的具體情況進(jìn)行定制和升級(jí)。
二、NGS實(shí)驗(yàn)室工作站的主要功能:
1、樣本前處理:
1>自動(dòng)完成樣本的分裝、標(biāo)記和存儲(chǔ),減少人為操作誤差。
2>自動(dòng)化進(jìn)行DNA/RNA的提取,采用磁珠法、硅膠膜法等高效提取技術(shù),確保核酸的純度和完整性。
3>樣本質(zhì)量控制,通過(guò)熒光定量、電泳等方法評(píng)估核酸質(zhì)量,確保后續(xù)實(shí)驗(yàn)的順利進(jìn)行。
2、文庫(kù)構(gòu)建:
1>自動(dòng)化完成DNA/RNA片段化、末端修復(fù)、加A尾、連接接頭等步驟,構(gòu)建測(cè)序文庫(kù)。
2>支持多種文庫(kù)構(gòu)建方案,如PCR-free文庫(kù)、單鏈文庫(kù)等,滿(mǎn)足不同測(cè)序平臺(tái)的需求。
3>文庫(kù)質(zhì)控,通過(guò)qPCR、文庫(kù)大小檢測(cè)等方法評(píng)估文庫(kù)質(zhì)量,確保文庫(kù)的有效性和均一性。
3、靶向序列捕獲(可選):
1>對(duì)于需要靶向測(cè)序的實(shí)驗(yàn),工作站可自動(dòng)化完成靶向序列的捕獲和富集。
2>支持多種捕獲技術(shù),如雜交捕獲、PCR擴(kuò)增捕獲等,提高測(cè)序的針對(duì)性和深度。
4、PCR擴(kuò)增:
1>自動(dòng)進(jìn)行文庫(kù)擴(kuò)增,確保文庫(kù)中的DNA/RNA分子達(dá)到測(cè)序所需的濃度。
2>可控的PCR循環(huán)數(shù)和溫度條件,減少擴(kuò)增偏差和非特異性擴(kuò)增。
5、測(cè)序前準(zhǔn)備:
1>對(duì)擴(kuò)增后的文庫(kù)進(jìn)行純化,去除未反應(yīng)的引物、dNTPs等雜質(zhì)。
2>定量檢測(cè)文庫(kù)濃度,確保每個(gè)測(cè)序通道上樣量的一致性。
3>將文庫(kù)加載到測(cè)序芯片或流動(dòng)池中,準(zhǔn)備進(jìn)行測(cè)序。
6、數(shù)據(jù)分析支持(部分工作站):
1>部分NGS實(shí)驗(yàn)室工作站集成了數(shù)據(jù)分析軟件或接口,能夠自動(dòng)處理測(cè)序數(shù)據(jù),進(jìn)行初步的數(shù)據(jù)質(zhì)控、比對(duì)、變異檢測(cè)等分析。
2>提供直觀的數(shù)據(jù)可視化工具,幫助研究人員快速理解實(shí)驗(yàn)結(jié)果。
7、自動(dòng)化管理:
1>配備有先進(jìn)的自動(dòng)化控制系統(tǒng)和軟件,能夠自動(dòng)執(zhí)行預(yù)設(shè)的實(shí)驗(yàn)流程,減少人工干預(yù)。
2>支持多任務(wù)并行處理,提高實(shí)驗(yàn)室的整體工作效率。
3>提供實(shí)驗(yàn)記錄和數(shù)據(jù)分析報(bào)告,便于實(shí)驗(yàn)室管理和科研項(xiàng)目的追蹤。
三、建設(shè)要求
NGS實(shí)驗(yàn)室工作站的建設(shè)需要符合一定的標(biāo)準(zhǔn)和要求,包括:
1、實(shí)驗(yàn)室環(huán)境:必須擁有符合相關(guān)規(guī)定的標(biāo)準(zhǔn)NGS實(shí)驗(yàn)室,確保實(shí)驗(yàn)室的無(wú)菌無(wú)塵環(huán)境。
2、設(shè)備配置:配備高通量測(cè)序儀及配套服務(wù)器、自動(dòng)分析軟件、實(shí)驗(yàn)室樣本信息管理系統(tǒng)等必要設(shè)備。
3、人員培訓(xùn):檢測(cè)人員必須通過(guò)專(zhuān)門(mén)的技能培訓(xùn),并獲得相應(yīng)的上崗證書(shū)。
4、管理制度:建立嚴(yán)格的實(shí)驗(yàn)室管理制度、標(biāo)準(zhǔn)化操作程序(SOP)和質(zhì)量管理文件,確保實(shí)驗(yàn)室日常運(yùn)行符合國(guó)家衛(wèi)生部的要求。
四、總結(jié)
NGS實(shí)驗(yàn)室工作站是高通量測(cè)序技術(shù)的重要支撐平臺(tái),通過(guò)高度自動(dòng)化、高精度和高效性的特點(diǎn),為臨床疾病篩查、診斷及科研提供了強(qiáng)有力的支持。隨著技術(shù)的不斷進(jìn)步和應(yīng)用的不斷擴(kuò)展,NGS實(shí)驗(yàn)室工作站將在更多領(lǐng)域發(fā)揮重要作用。
經(jīng)驗(yàn)豐富的服務(wù)團(tuán)隊(duì)和強(qiáng)大的生產(chǎn)支持團(tuán)隊(duì)為客戶(hù)提供無(wú)憂(yōu)的訂單服務(wù)。
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