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如何使用Flex平臺(tái)完成NGS文庫(kù)建庫(kù)全過程?
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NGS文庫(kù)制備是指將目標(biāo)DNA或RNA片段轉(zhuǎn)化為測(cè)序儀器能夠讀取的形式的過程。這通常包括將DNA或RNA打斷成適當(dāng)大小的片段、進(jìn)行末端修復(fù)、接頭連接、純化以及擴(kuò)增等步驟,最終生成一個(gè)包含大量小片段DNA或RNA的集合,即文庫(kù)。這個(gè)文庫(kù)可以直接加載到測(cè)序儀上進(jìn)行高通量測(cè)序。
Opentrons Flex NGS 文庫(kù)制備工作站
一、NGS文庫(kù)制備的功能
1、支持高通量測(cè)序:
NGS文庫(kù)制備的主要功能是為高通量測(cè)序提供高質(zhì)量的測(cè)序樣本。通過制備好的文庫(kù),測(cè)序儀能夠高效地讀取大量的遺傳信息,從而進(jìn)行后續(xù)的基因組學(xué)研究、轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究以及疾病相關(guān)基因變異的研究。
2、提高測(cè)序效率:
制備好的文庫(kù)能夠顯著提高測(cè)序效率。通過優(yōu)化文庫(kù)制備過程中的各個(gè)步驟,如提高DNA片段化效率、優(yōu)化接頭連接條件等,可以確保測(cè)序儀能夠準(zhǔn)確地讀取每個(gè)片段的序列信息,從而提高測(cè)序的準(zhǔn)確性和可靠性。
3、降低測(cè)序成本:
NGS文庫(kù)制備技術(shù)還可以在一定程度上降低測(cè)序成本。通過優(yōu)化文庫(kù)制備方法和提高測(cè)序效率,可以減少測(cè)序所需的試劑和儀器使用成本,從而降低整體的測(cè)序成本。
4、支持多樣化研究:
制備好的NGS文庫(kù)可以用于多種類型的研究。例如,可以用于基因組重測(cè)序、轉(zhuǎn)錄組測(cè)序、表觀基因組測(cè)序等不同類型的測(cè)序項(xiàng)目,從而滿足研究人員對(duì)不同類型遺傳信息的分析需求。
5、促進(jìn)科研進(jìn)展:
NGS文庫(kù)制備技術(shù)的發(fā)展推動(dòng)了科研進(jìn)展。通過高通量測(cè)序技術(shù),研究人員能夠更深入地了解生物體的遺傳特征、基因表達(dá)模式以及疾病發(fā)生機(jī)制等,從而為疾病治療、藥物研發(fā)等領(lǐng)域提供新的思路和方法。
二、Opentrons Flex NGS 文庫(kù)制備
1、全流程自動(dòng)化文庫(kù)制備
Opentrons Flex NGS文庫(kù)制備工作站具備建庫(kù)功能全流程的自動(dòng)化能力,可以滿足NGS和PCR應(yīng)用中的樣品和文庫(kù)制備需求。這包括試劑分配、磁珠處理以及一般生化和基因組轉(zhuǎn)移等環(huán)節(jié),能夠大幅度減少全流程所需時(shí)間和手動(dòng)操作的勞動(dòng)強(qiáng)度。
2、高效處理高通量樣本
該工作站配備了Flex移液器和相應(yīng)的耗材,以及多種模塊,如熱循環(huán)模塊、溫度模塊、熱振蕩模塊和環(huán)形磁力架等。這些多元模塊協(xié)作運(yùn)行,使得樣本處理的通量高達(dá)96個(gè),能夠高效地完成96個(gè)樣本的文庫(kù)制備流程。
3、兼容多種試劑和方案
Opentrons Flex NGS文庫(kù)制備工作站已通過多款試劑適配測(cè)試,并可擴(kuò)展適配所有試劑方案。這意味著實(shí)驗(yàn)室可以根據(jù)自身需求選擇合適的試劑進(jìn)行文庫(kù)制備,無需擔(dān)心兼容性問題。
4、精準(zhǔn)移液和品控保障
該工作站具備精準(zhǔn)的移液能力,品控嚴(yán)格,出廠前經(jīng)過先進(jìn)檢驗(yàn),確保移液精準(zhǔn)度和合格率。這有助于保證文庫(kù)制備的質(zhì)量和一致性。
5、圖形化操作和編程支持
Opentrons Flex NGS文庫(kù)制備工作站提供圖形化操作界面,并支持Python編程,這使得操作更加便捷和靈活。用戶可以根據(jù)實(shí)驗(yàn)需求進(jìn)行自定義編程,實(shí)現(xiàn)更復(fù)雜的文庫(kù)制備流程。
6、支持多種文庫(kù)制備類型
該工作站不僅支持?jǐn)U增子建庫(kù),還可以用于其他類型的文庫(kù)制備,如基因組文庫(kù)、轉(zhuǎn)錄組文庫(kù)等。這使得Opentrons Flex NGS文庫(kù)制備工作站能夠滿足多種實(shí)驗(yàn)需求。
Opentrons Flex NGS工作站極大地減輕了文庫(kù)制備過程中的手動(dòng)操作負(fù)擔(dān),同時(shí),在確保品控與精準(zhǔn)度的前提下,顯著提升了實(shí)驗(yàn)的準(zhǔn)確性和可重復(fù)性。無論是擴(kuò)增子建庫(kù),還是其他類型的文庫(kù)制備需求,Opentrons Flex NGS工作站都能憑借其出色的性能,充分滿足實(shí)驗(yàn)室的多樣化需求。
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