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如何使用Flex平臺完成NGS文庫建庫全過程?

下一代測序(NGS)技術已經(jīng)成為生命科學研究和臨床診斷的重要工具,而文庫建庫作為NGS流程中的關鍵環(huán)節(jié),直接影響測序質量和結果可靠性。傳統(tǒng)手工建庫操作繁瑣且易出錯,自動化平臺成為提升效率和準確性的必然選擇。Opentrons的Flex平臺以其高精度和靈活性,助力實驗室實現(xiàn)NGS文庫建庫全過程自動化。
本文將詳細介紹如何使用Flex平臺完成從樣本準備到最終文庫生成的完整流程,幫助您高效、精準地完成NGS建庫任務。

如何使用Flex平臺完成NGS文庫建庫全過程?

移液工作站

一、樣本準備與初始上樣
在Flex平臺上,首先將提取的DNA或RNA樣本放置于合適的微孔板中。利用Flex平臺的多通道移液功能,準確將樣本分裝到建庫板的指定孔位,同時自動加入相應的緩沖液和酶液,為后續(xù)反應做好準備。
平臺支持自定義體積和移液速度,確保樣本處理的均一性和穩(wěn)定性。

二、DNA片段化與末端修復
Flex平臺可自動執(zhí)行DNA片段化步驟,結合物理或酶學方法,使DNA片段符合建庫需求。隨后進行末端修復和加A尾處理,平臺精準控制試劑添加和反應時間,保證文庫片段的完整性和適合后續(xù)接頭連接。

三、接頭連接
通過Flex平臺的自動化移液和溫控模塊,完成接頭的高效連接。系統(tǒng)確保反應條件的精準控制,降低接頭二聚體和非特異產物的生成,提高文庫質量。

四、磁珠純化與文庫洗脫
Flex平臺集成磁力模塊,自動完成磁珠結合、洗滌和洗脫步驟。磁珠純化不僅能去除雜質,還能回收目標文庫片段。自動化流程減少人為操作,提升純化效率和一致性。

五、PCR擴增
Flex平臺利用溫控模塊,自動完成PCR擴增反應。用戶可設置循環(huán)數(shù)和溫度梯度,確保文庫獲得足夠的量,同時避免過度擴增帶來的偏差。

六、文庫質控與儲存
完成擴增后,F(xiàn)lex平臺可協(xié)助用戶完成文庫的體積調整和儲存準備。部分流程還可對文庫進行初步質控操作,為后續(xù)測序做準備。

七、軟件與流程管理優(yōu)勢
Flex平臺配套的軟件界面支持全流程的自動化腳本設計和參數(shù)調整,用戶無需編程即可快速設置建庫流程。流程執(zhí)行實時監(jiān)控,確保每一步都符合預設標準,操作數(shù)據(jù)自動記錄,方便追溯與優(yōu)化。

使用Opentrons的Flex平臺完成NGS文庫建庫全過程,實現(xiàn)了從樣本分裝、片段化、接頭連接、磁珠純化到PCR擴增的全自動操作。該平臺不僅大幅提升實驗效率和通量,還顯著提高了建庫的重復性和準確性,適合臨床、科研及商業(yè)測序實驗室。

如需了解更多Flex平臺在NGS建庫中的應用細節(jié)或預約產品演示,歡迎聯(lián)系Opentrons技術支持團隊。

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