Zymo Research為從事新冠病毒檢測的研究人員提供生物醫(yī)學(xué)工具和服務(wù)，包括為Opentrons客戶提供支持。

Zymo Research 是一家為研究人員提供生物醫(yī)學(xué)工具和服務(wù)的企業(yè)。目前，他們正在幫助各大實(shí)驗(yàn)室進(jìn)行新冠病毒檢測。為此他們創(chuàng)建了一個(gè)從樣本收集、RNA 提取到基于rRT-PCR檢測的完整的新冠病毒檢測工作流程，該工作流程已經(jīng)進(jìn)入FDA的緊急使用授權(quán)前審查狀態(tài)中。Zymo Research 作為 Opentrons 的聯(lián)合開發(fā)測試系統(tǒng)合作伙伴，Zymo Research 愿意為任何有興趣將該工作流程加載到 Opentrons 液體處理機(jī)器人上的組織提供技術(shù)支持。

今天我們邀請到 Zymo 的研究專家 Casey Cruz 為大家分享他們?nèi)绾问褂?OT-2 進(jìn)行新冠檢測，協(xié)助抗擊全球疫情。

Opentrons: 疫情爆發(fā)前，您的日常生活是怎樣的？

Casey Cruz:?在疫情爆發(fā)前，我們最初購買 OT-2 是為了做 RNA-Seq 文庫制備的，后期假如我們的工作不再需要用于新冠檢測，我們?nèi)匀环浅Ｆ诖c Opentrons 合作開展這個(gè)項(xiàng)目。為此，我們甚至編寫了一個(gè)用于 rRT-PCR 設(shè)置的腳本，并希望將其應(yīng)用于 Pangea 實(shí)驗(yàn)室的 SARA-CoV-2 實(shí)驗(yàn)室開發(fā)的測試（LDT）。作為 RiboFree RNA-Seq試劑盒的產(chǎn)品經(jīng)理，我被OT-2的價(jià)格和 Opentrons 的開源社區(qū)所吸引。在項(xiàng)目初步驗(yàn)證期它的各方面表現(xiàn)都很棒，但由于疫情爆發(fā)，我不得不暫時(shí)改變研究方向，轉(zhuǎn)而投入到協(xié)助新冠病毒檢測項(xiàng)目中。

Opentrons: 您現(xiàn)在所做的工作與您的日常工作內(nèi)容有什么不同嗎？

Casey:?我們現(xiàn)在的工作是提交關(guān)于新冠病毒檢測工作流程的 FDA 緊急使用授權(quán)申請。這個(gè)項(xiàng)目工作流程包含從樣本采集到 RNA 提取再到 rRT-PCR 檢測，從運(yùn)輸介質(zhì) DNA/RNA 保護(hù)劑開始，在樣本收集和運(yùn)輸過程中需要把新冠病毒完全滅活，這樣就可以保證 RNA 在室溫下能夠最高保存30天。這是在實(shí)際應(yīng)用中一個(gè)很好的方法，使生物樣本中的 DNA/RNA 可以在沒有冷鏈的情況下保存，當(dāng)樣本被運(yùn)回實(shí)驗(yàn)室就可以用于自動化樣本處理工作流程。

接下來，我們使用 Quick-DNA/RNA Viral MagBead Kit 試劑盒進(jìn)行 RNA 提取，并使用 Quick-SARS-CoV-2 rRT-PCR Test Kit 試劑盒完成新冠病毒檢測的工作流程。

Pangea 實(shí)驗(yàn)室是一家獲得 CLIA 認(rèn)證和 CAP 認(rèn)證的臨床測試實(shí)驗(yàn)室，這里的 SARA-CoV-2 實(shí)驗(yàn)室開發(fā)測試 (LDT) 是從收到樣本開始，然后他們使用 KingFisher 提取 RNA，使用 Quick-SARS-CoV-2 rRT-PCR 試劑盒檢測新冠病毒。該工作流程使用的試劑是 Zymo Research 目前正在等待美國食藥監(jiān)局（FDA）緊急使用授權(quán)（EUA）的試劑。讓這個(gè)系統(tǒng)啟動并運(yùn)行，并為申請緊急使用授權(quán)（EUA）進(jìn)行驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)，是 Pangea 團(tuán)隊(duì)目前正在做的主要工作。

Opentrons: 新冠病毒檢測項(xiàng)目中，最讓您感到興奮的是什么？

Casey:?最讓我興奮的是，這個(gè)項(xiàng)目在這個(gè)關(guān)鍵時(shí)刻正在幫助有需要的人們。很多時(shí)候，當(dāng)你做研究時(shí)，你會感覺與結(jié)果相去甚遠(yuǎn)，但這次不同。通過這個(gè)新冠檢測工作流程，我能明顯地感受到我們的技術(shù)正在幫助醫(yī)療專業(yè)人員并幫助阻止疾病的傳播，這將關(guān)系到很多人的生命健康。我很感激能夠?yàn)榇俗龀鲐暙I(xiàn)，這對世界將產(chǎn)生持久的影響并真正發(fā)揮作用。

Opentrons: 關(guān)于這個(gè)項(xiàng)目，您認(rèn)為關(guān)鍵要點(diǎn)是什么？

Casey:?我認(rèn)為關(guān)鍵在于確保安全運(yùn)輸臨床樣本。DNA/RNA 保護(hù)劑可確保病毒滅活，從而保證進(jìn)行診斷測試的人員安全；檢測人員需要做的就是對試管外部進(jìn)行去污處理，確保樣本就可以安全使用。我們非常重視確保從樣本采集開始的診斷全過程安全性和準(zhǔn)確性。

如果您想在自己的實(shí)驗(yàn)室中部署同款 Opentrons 系統(tǒng)，請聯(lián)系 covid-19@opentrons.com。