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2019 年 12 月 13 日

Opentrons 客戶訪談 | 太平洋大學(xué)教授 John Livesey

太平洋大學(xué)教授 John Livesey 向我們介紹了他是如何使用 OT-2 自動(dòng)化移液平臺(tái)進(jìn)行抗癌藥物開發(fā)以及培訓(xùn)未來生物學(xué)家的。

John Livesey 博士在加州薩克拉門托的太平洋大學(xué)擔(dān)任教授已有25年,他負(fù)責(zé)教未來的藥劑師和藥物科學(xué)家內(nèi)分泌生理學(xué)和癌癥生物學(xué),他的研究旨在增進(jìn)對(duì)如何使用藥物劑治療人類疾病的理解。

今年早些時(shí)候,他引入了一位新的科研伙伴——Opentrons 的 OT-2 自動(dòng)化移液平臺(tái)。我們采訪了 John Livesey 博士,共同探討了 OT-2 如何幫助學(xué)生減少實(shí)驗(yàn)操作的焦慮,使他們更加專注于可能挽救生命的研究工作。

OPENTRONS: 能否請(qǐng)您分享一下您目前的研究?jī)?nèi)容?

DR. JOHN LIVESEY: 我的研究?jī)?nèi)容主要關(guān)于 EMT 的過程,這是一個(gè)與癌癥轉(zhuǎn)移擴(kuò)散緊密相關(guān)的生物學(xué)過程。在實(shí)驗(yàn)中,我將細(xì)胞置于多孔板中,對(duì)其進(jìn)行培養(yǎng)、藥物處理,并調(diào)整 pH 值和其他環(huán)境因素。通過細(xì)胞內(nèi) Western 過程,我測(cè)量了 EMT 過程中特定標(biāo)記的表達(dá)。

OPENTRONS: 是什么促使您將 OT-2 引入您的實(shí)驗(yàn)室?

JOHN:?目前我知道許多學(xué)生在實(shí)驗(yàn)操作方面經(jīng)驗(yàn)不足,也沒有太多時(shí)間練習(xí),因此他們?cè)谶M(jìn)行液體處理和操作時(shí)通常會(huì)感到焦慮,擔(dān)心自己的操作不夠準(zhǔn)確和到位。對(duì)于一些學(xué)生來說,一個(gè)實(shí)驗(yàn)需要耗費(fèi)數(shù)周的努力,如果失敗了,他們就會(huì)失去一個(gè)學(xué)期的大部分時(shí)間。他們也了解我們的預(yù)算緊張,當(dāng)他們面臨不得不丟棄 96 孔板項(xiàng)目中某列或某行的實(shí)驗(yàn)時(shí),或者在實(shí)驗(yàn)過程中如果不小心錯(cuò)混了樣本或漏加了試劑,他們會(huì)擔(dān)心他們?cè)斐傻氖д`導(dǎo)致實(shí)驗(yàn)成本無(wú)法負(fù)擔(dān)。

這時(shí) Opentrons 自動(dòng)化移液平臺(tái)的出現(xiàn),為這些問題提供了一個(gè)相對(duì)適中的解決方案。通過投資自動(dòng)化,學(xué)生們可以專注于藥理學(xué):如何設(shè)置處理方法、如何處理細(xì)胞以及如何分析和解釋數(shù)據(jù)。OT-2 可以在許多步驟中提供幫助,使學(xué)生們擺脫實(shí)際的機(jī)械操作和相關(guān)的焦慮。

OPENTRONS: 您的 Opentrons 自動(dòng)化移液平臺(tái)運(yùn)行順利嗎?

JOHN: 非常順利!開箱、設(shè)置和進(jìn)行初始校準(zhǔn)都很簡(jiǎn)單。我在 5 月份購(gòu)買了 OT-2,最開始我以為需要學(xué)習(xí)編程,但我的第一次使用 OT-2 時(shí)恰逢 Protocol Designer 的發(fā)布和公開測(cè)試版發(fā)布,幾乎就在同一天。時(shí)機(jī)再好不過了!我沒有浪費(fèi)大量時(shí)間學(xué)習(xí) Python 或依賴 Opentrons 進(jìn)行編程。

OPENTRONS: 能否詳細(xì)告訴我們您是如何使用 Protocol Designer 為 OT-2 編程的?

JOHN: ?Protocol Designer 的出現(xiàn)如同及時(shí)雨,極大地解決了我們的困擾。我原本以為我們使用 OT-2 只需要開發(fā)幾個(gè)協(xié)議,然后進(jìn)行一些微小的修改,重復(fù)使用它們。但事實(shí)上,雖然有時(shí)我也會(huì)重復(fù)使用協(xié)議,但我們幾乎總是需要對(duì)它們進(jìn)行一些調(diào)整。T

?Protocol Designer 的出現(xiàn)如同及時(shí)雨,極大地解決了我們的困擾。

就在昨天,我與一個(gè)本科生研究團(tuán)隊(duì)合作。前一天晚上,我花了半個(gè)小時(shí)為他們正在進(jìn)行的實(shí)驗(yàn)制定了一個(gè)全新的協(xié)議。在第一次運(yùn)行中途,我意識(shí)到我需要做出改變。我進(jìn)入?yún)f(xié)議并對(duì)其進(jìn)行了修改,供第二組學(xué)生當(dāng)天晚些時(shí)候使用。這一功能可用并且相當(dāng)容易完成,意味著您可以相對(duì)快速地糾正自己的錯(cuò)誤。如果我必須通過 Python 變成,我就無(wú)法做到這一點(diǎn)。這使 OT-2 更加靈活和用戶友好。

Protocol Designer 的便捷性使我們能夠相對(duì)迅速地糾正自己的錯(cuò)誤。

OPENTRONS: OT-2 為您的學(xué)生提供了哪些其他便利?

JOHN:?OT-2 無(wú)疑加快了他們進(jìn)行實(shí)驗(yàn)的頻率,增加了他們獲得研究成果作者身份的可能性。去年,一名研究型學(xué)生一個(gè)學(xué)期能完成兩到三個(gè)實(shí)驗(yàn)就算幸運(yùn)了。學(xué)生們每周只有三到四個(gè)小時(shí)的時(shí)間工作,而單個(gè)實(shí)驗(yàn)可能需要幾天甚至幾周來完成許多步驟:這種努力的速度永遠(yuǎn)無(wú)法發(fā)表論文,甚至無(wú)法在論文的背面提及。

隨著設(shè)備應(yīng)用提升的速度和生產(chǎn)力,我們將能夠匯集多個(gè)學(xué)生團(tuán)隊(duì)的努力,在一個(gè)學(xué)期內(nèi)完成大約10到15個(gè)實(shí)驗(yàn),并在更合理的時(shí)間框架內(nèi)發(fā)表論文。

OT-2也是一個(gè)很好的教學(xué)工具。它使學(xué)生們能夠更全面地探索研究問題。我通常會(huì)給學(xué)生們一個(gè)問題,讓他們通過研究來回答,而很少有學(xué)生有足夠的時(shí)間和精力來提出一個(gè)答案。OT-2 提供了一種寶貴的學(xué)習(xí)方式,可以讓學(xué)生們擺脫移液焦慮,以便他們能夠參與這種更高層次的問題解決。

OPENTRONS: 關(guān)于您的 Opentrons 自動(dòng)化移液平臺(tái)您還有其他想要分享嗎?

JOHN:?其實(shí)項(xiàng)目的整個(gè)過程非常有趣。我們甚至給我們的 OT-2 起了一個(gè)名字,我們叫它 Pinocchio,因?yàn)槿绻娴暮芎?,也許它會(huì)成為一個(gè)真正的藥理學(xué)家。當(dāng)然,控制它的電腦是 Geppetto。

學(xué)生們真的很想和它一起工作,而且他們也很適應(yīng)它。在學(xué)年期間,我們有10名或更多的本科生和藥劑學(xué)博士生幾乎不停地使用它進(jìn)行他們的研究項(xiàng)目——幾乎爭(zhēng)搶著使用它。在夏天,我的高中實(shí)習(xí)生為細(xì)胞處理的單獨(dú)操作設(shè)計(jì)了他們自己的協(xié)議。通常,我們會(huì)手動(dòng)完成這項(xiàng)工作?,F(xiàn)在,基于與 OT-2 的這些互動(dòng),那名學(xué)生改變了理想,現(xiàn)在他想成為一名工程師。

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