單細(xì)胞 RNA 測序能夠以單細(xì)胞為單位進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析，這項(xiàng)研究可以讓我們進(jìn)一步了解一些稀有且貴重的細(xì)胞群。盡管單細(xì)胞RNA測序技術(shù)的使用越來越廣泛，但這項(xiàng)技術(shù)的成本仍然相當(dāng)昂貴。除了測序平臺和每次單獨(dú)運(yùn)行的成本外，文庫制備步驟既昂貴又費(fèi)力。然而，把文庫制備步驟進(jìn)行自動化可以有效減少實(shí)驗(yàn)結(jié)果的變異性，同時(shí)節(jié)約研究人員的寶貴時(shí)間，解放他們的雙手，讓科研人員能有更多時(shí)間用來來設(shè)計(jì)實(shí)驗(yàn)或分析數(shù)據(jù)。

目前，市面上能實(shí)現(xiàn)單細(xì)胞RNA測序的自動化文庫制備成本高達(dá) 26萬美元，昂貴的成本已經(jīng)超出了市面上大部分小型研究實(shí)驗(yàn)室的預(yù)算。為了向更多實(shí)驗(yàn)室提供這項(xiàng)自動化技術(shù)，Retro Biosciences 成功“破解”了 Opentrons 的 OT-2 自動化移液平臺，使其能夠?qū)崿F(xiàn)自動化文庫制備功能，同時(shí)成本僅為 2.6萬美元！節(jié)約了10倍的啟動成本。

Retro Biosciences?是一家位于加州的生物醫(yī)藥公司，專注于血漿療法、細(xì)胞重編程和細(xì)胞自噬研究。

Q: 請簡單介紹一下Retro Biosciences 公司？
A: Retro Biosciences 的成立最初是一家臨床治療藥物研發(fā)公司，后來主要業(yè)務(wù)是開發(fā)預(yù)防性藥物來解決細(xì)胞衰老問題。大多數(shù)研究衰老的生物學(xué)公司都專注于單一的衰老機(jī)制，而 Retro Biosciences 是一家多項(xiàng)目公司，我們努力探索的三種療法有：細(xì)胞重編程、自噬和血漿啟發(fā)療法。我們了解到醫(yī)院接待的病人中有 80% 以上的疾病負(fù)擔(dān)源自于衰老機(jī)制，因此我們希望找到能直接解決這些問題的療法，幫助更多病人。

Q:?自動化如何幫助您實(shí)現(xiàn)目標(biāo)？
A: 機(jī)器自動化是不知疲倦的，可以持續(xù)性工作，同時(shí)自動化的效率顯著超越人工。我們正在探索未知的生物學(xué)，其中一些探索涉及到的參數(shù)以及參數(shù)組合非常廣泛，如果繼續(xù)讓科研人員使用手動的方式進(jìn)行實(shí)驗(yàn)，我認(rèn)為這是對研究者科學(xué)頭腦的一種浪費(fèi)。

Q: 您為自動化單細(xì)胞RNA測序的文庫制備創(chuàng)建了一個(gè)非常酷且非常實(shí)惠的解決方案。請告訴我們您創(chuàng)造這個(gè)方案的初衷，以及您是如何做到的？
A: 文庫制備對我們來說是一個(gè)入門項(xiàng)目。自動化的最大優(yōu)勢是你可以將那些固有的、大量重復(fù)的、最不希望出錯(cuò)的環(huán)節(jié)自動運(yùn)作起來，節(jié)約時(shí)間，減少人工失誤。我們在這里做了很多單細(xì)胞RNA測序。每一次測序我們需要面臨的分析和研究任務(wù)都很重，因此我們必須開發(fā)新的軟件功能（例如液位特定移液）和硬件功能（例如改進(jìn)的磁珠分離系統(tǒng)），它使我們能夠直觀地審查協(xié)議中的所有步驟，以發(fā)現(xiàn)錯(cuò)誤并驗(yàn)證質(zhì)量。

Q: 您在 Github?上發(fā)表了這項(xiàng)工作，引發(fā)了不錯(cuò)的反響， 您為什么決定公開這項(xiàng)工作？
A:?對我們來說，在廣泛的生物學(xué)研究中降低科研成本對社會的好處，遠(yuǎn)遠(yuǎn)超過了我們對同行的競爭關(guān)系的狹隘擔(dān)憂。我們希望有更多從事同類研究的科研者可以從自動化中獲益。

Retro Biosciences 通過展示Opentrons開源自動化移液系統(tǒng)創(chuàng)造了屬于自己的單細(xì)胞測序文庫制備自動化流程，幫助了更多研究單細(xì)胞測序的實(shí)驗(yàn)室能夠啟動自動化，提升他們的研究效率。我們的開源自動化程序可以通過編程來完成研究人員需要的任何事情，同時(shí)把成本控制在較低的范圍內(nèi)。我們被 Retro Biosciences 引領(lǐng)的創(chuàng)新所震撼，期待他們未來的持續(xù)創(chuàng)新。