一個(gè)強(qiáng)大的生物工廠不需要數(shù)百萬(wàn)美元的投資——經(jīng)濟(jì)實(shí)惠的開(kāi)源工具讓每個(gè)實(shí)驗(yàn)室都有可能實(shí)現(xiàn)這些功能。

DAMP 實(shí)驗(yàn)室是波士頓大學(xué)生物設(shè)計(jì)中心內(nèi)一個(gè)初創(chuàng)的生物工廠。該實(shí)驗(yàn)室僅使用不到 10,000 美元的開(kāi)源軟件和硬件，就為科學(xué)界提供了 30 種合成生物學(xué)方案（如DNA組裝、轉(zhuǎn)化、測(cè)序和質(zhì)粒純化等），并以此收取服務(wù)費(fèi)。任何科學(xué)家都可以通過(guò)訪問(wèn) DAMP 實(shí)驗(yàn)室的網(wǎng)頁(yè)界面遠(yuǎn)程指定實(shí)驗(yàn)計(jì)劃，其自動(dòng)化系統(tǒng)能夠設(shè)計(jì)、構(gòu)建和測(cè)試該計(jì)劃。

他們是如何做到的呢？

通過(guò)整合一系列開(kāi)源工具，DAMP實(shí)驗(yàn)室能夠快速開(kāi)發(fā)一個(gè)復(fù)雜的系統(tǒng)，該系統(tǒng)能夠高效且優(yōu)雅地自動(dòng)化執(zhí)行生物回路測(cè)試。其中一些關(guān)鍵的開(kāi)源工具包括：

• Cello 使用Verilog編程語(yǔ)言實(shí)現(xiàn)生物回路的自動(dòng)化設(shè)計(jì)。
• Aquarium 用于實(shí)驗(yàn)室信息管理系統(tǒng)（LIMS），實(shí)現(xiàn)作業(yè)排隊(duì)和庫(kù)存管理。
• Opentrons 的OT-2移液機(jī)器人：用于自動(dòng)化DNA組裝、轉(zhuǎn)化和其他許多方案。

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為什么DAMP實(shí)驗(yàn)室的生物工廠和開(kāi)源技術(shù)如此重要？

DAMP實(shí)驗(yàn)室在視頻中談到了開(kāi)源技術(shù)和它賦予的能力。

該項(xiàng)目展示了開(kāi)源軟件和硬件在實(shí)驗(yàn)室中的力量。如果手動(dòng)執(zhí)行所有這些過(guò)程，DAMP實(shí)驗(yàn)室需要一周時(shí)間來(lái)設(shè)計(jì)、構(gòu)建和測(cè)試10個(gè)基因回路。通過(guò)在開(kāi)源技術(shù)上投入相對(duì)較少的資金，DAMP實(shí)驗(yàn)室的吞吐量提高了10倍。

結(jié)果就是，DAMP實(shí)驗(yàn)室能夠用相同的設(shè)施和團(tuán)隊(duì)執(zhí)行10倍的實(shí)驗(yàn)。開(kāi)源工具提高了生產(chǎn)效率，大大降低了執(zhí)行復(fù)雜實(shí)驗(yàn)的成本。

一個(gè)強(qiáng)大的生物工廠不需要數(shù)百萬(wàn)美元的投資——經(jīng)濟(jì)實(shí)惠的開(kāi)源工具讓每個(gè)實(shí)驗(yàn)室都有可能實(shí)現(xiàn)這些功能。